Die Fakultät für Naturwissenschaften wurde 1920 als fünfte Fakultät der Karlsuniversität gegründet. Es hat derzeit 29 Abteilungen, 3 Museen und einen großen Botanischen Garten, in dem sich die Studienabteilung und einige Studenteneinrichtungen befinden.

Heutzutage ist die Fakultät akademisch und organisatorisch in vier Bereiche unterteilt: biologische, geographische, geologische und chemische. Neben diesen Sektionen verfügt die Fakultät über mehrere Fachlehr- und Forschungszentren, darunter interdisziplinäre Einrichtungen wie das Institut für Umweltstudien. Alle Teile der Fakultät sind sowohl in der Lehre als auch in der Forschung tätig.

Die Hauptaufgabe der Fakultät für Naturwissenschaften ist es, hochqualifizierte Experten in Biologie, Chemie, Geographie, Geologie und anderen interdisziplinären Bereichen zu schaffen. Ihre wissenschaftlichen und Forschungsanstrengungen zielen darauf ab, Schlüsselprobleme zu lösen, die mit der Entwicklung der menschlichen Gesellschaft zu tun haben. Einige der vorrangigen langfristigen Themen sind die menschliche Gesundheit, das Studium der Funktion und Vorhersage der Entwicklung von Ökosystemen und der Biosphäre sowie die Entwicklung von umweltfreundlichen Materialien auf der Grundlage der Nutzung erneuerbarer Ressourcen.

Die Fakultät für Naturwissenschaften bietet drei Bildungsstufen, Bachelor, Master und Doktorat. Alle Bachelor- und Master-Studiengänge umfassen sowohl theoretischen Unterricht als auch praktische Übungen in Laboratorien, und einige Kurse kombinieren das naturwissenschaftliche Studium mit der Lehrerausbildung in einem gewählten Bereich. Bachelor-Studiengänge sind Einführungen in vertiefende Studien, die in den Master-Studiengängen folgen. Masterstudiengänge bilden Experten für Wissenschafts- und Forschungsinstitute, Regierungskarrieren, Industrie und Privatwirtschaft aus. Absolventinnen und Absolventen der Master-Studiengänge mit dem Lehramtselement sind in Sekundar- und Berufsfachschulen qualifiziert. Doktorandenprogramme bilden hochspezialisiertes Personal für Wissenschafts- und Forschungsaktivitäten aus.